目前醫學界普遍透過使用抗生素，和酸抑制組合療法來根除幽門螺旋桿菌，藉以減少胃癌情況惡化及胃潰瘍併發症的風險，然而使用抗生素卻可能意外地改變腸道中存在的微生物。香港大學李嘉誠醫學院（港大醫學院）臨床醫學學院內科學系梁偉強教授與美國貝勒醫學院的研究團隊，發現使用抗生素和酸抑制組合療法後，腸道中病毒群落的多樣性有所減少。同時發現有別於腸道細菌群落組成的變化，腸道細菌群落通常在6個月後恢復，病毒群落則持續收縮6個月以上。
幽門螺旋桿菌為胃癌和消化性潰瘍的主要病因。據估計，以往全球約有50％的人口感染幽門螺旋桿菌，尤其在亞洲地區，包括中國。港大醫學院和美國貝勒醫學院的研究團隊合作，對過去40年來全球幽門螺旋桿菌的感染率進行了全面的系統回顧及統合分析，包括來自71個國家224個研究報告。
研究發現，全球幽門螺旋桿菌的感染率一直在下降，從1980至1990年的58.2％下降到2011至2022年間的43.1％。總體而言，全球幽門螺旋桿菌的感染率每年約下降0.39-0.83％。下降趨勢在最近10年（2010至2020年）特別明顯，並且在所有六個世界衞生組織區域，包括，非洲、美洲、歐洲、東地中海、東南亞及西太平洋。研究團隊最新的估計顯示，全球現有超過40％的成年人口感染幽門螺旋桿菌，對醫療系統造成重大負擔，尤其是與消化性潰瘍疾病和胃癌發病率及死亡率有關的方面。
目前，醫學界普遍透過使用抗生素和酸抑制組合療法來根除幽門螺旋桿菌，梁偉強教授的團隊指出，使用抗生素消除幽門螺旋桿菌，不僅有機會意外改變腸道細菌群落狀況，更可能會令腸道中存在的病毒群落 (virome) 結構被重新塑造。而通過利用宏基因組學測序技術，團隊發現使用抗生素和酸抑制組合療法後，腸道中病毒群落的多樣性有所減少。
研究團隊也發現，有別於腸道細菌群落組成的變化，腸道細菌群落通常在6個月後恢復，病毒群落則持續收縮6個月以上。多次使用抗生素治療將進一步降低病毒群落的多樣性。改變腸道病毒群落多樣性不僅會影響人體健康，而且更可能因為改變腸道噬菌體而影響抗生素的耐受性。
梁偉強解釋，另一項研究重點指出，抗生素組合療法對腸道中存在的病毒群落帶來潛在影響，不僅會影響人體健康，更可能因為改變腸道噬菌體而影響抗生素的耐受性。
