港鐵沙中線所交報告前後矛盾,圖則更與屋宇署所批有嚴重偏差。港鐵主席馬時亨指港鐵董事局被工程管理層蒙在鼓裹,表示失望及不能接受,並會嚴肅看待。對此,馬時亨宣佈管理層將會重組。工程總監黃唯銘及另外三名總經理已經請辭,即時生效。在委任新的工程總監前,由常務總監金澤培督導港鐵工程。行政總裁梁國權已申請提早退休,但會暫時留任,直至繼任人上任為止。而馬時亨指自己尊重問責精神,曾向特首兩次請辭,但不獲接納。他指政府要求他留下領導行政總裁遴選委員會,直至繼任行政總裁上任。
對於圖則有嚴重偏差,行政總裁梁國權表示是港鐵人員進行安全測試時發現。他指承建商並無任何相關記錄,而且沒有告知港鐵,港鐵人員也沒有提醒承建商須遞交記錄。他指會再找專家調查,更新調查報告,再提交政府。