創新及科技局長薛永恒表示，當局已就新的「港版健康碼」，提出包市民自行記錄每日的行蹤多個方案，交由衞生專家去決定，希望有助內地與本港可以早日恢復通關。全國人大常委譚耀宗表示，如果特區政府依賴市民自行申報行蹤，恐怕內地不會接受及放心，他對政府可以成功爭取通關並不樂觀，指政府拖延耽誤工作，既想通關，又不依照內地的標準行事。
薛永恒在一個電視節目上表示，為配合內地的防疫政策，當局就更新「港版健康碼」已經提出不同的方案，並提交食物及衞生局，據他所知，當局已經轉交內地部門審視。薛永恒指，當局提出的方案包括市民自行記錄每日的行蹤、由當局制定高危地方清單，讓市民檢視過往14或21日內有否曾經到過清單上的地點，以及配合「安心出行」應用程式，經當事人同意下，上載行蹤資料。
但全國人大常委譚耀宗認為，若要早日與內地就恢復通關達成共識，有需要依照內地的檢疫標準辦事，他不猜測特區政府是顧慮民意，抑或不了解國情，但他相信，若果具追蹤功能的健康碼只適用於過關人士，相信市民會接受。
身兼港區人大的工聯會會長吳秋北亦指出，中央防疫措施抓得比較緊，不想有外來輸入風險，令防疫壓力增加，是可以理解。他認為，日後本港的「健康碼」應要與內地系統互通，才能有效追蹤病源，如果技術上作調整，相信內地系統可在香港使用。他又指，有追蹤效能的「健康碼」是很好的措施，希望市民屆時自願安裝，在內地有交流或有工作的人士應該會歡迎。
呼吸系統科專科醫生梁子超表示，兩地的系統、基建及法規都不同，相信兩款健康碼很難完全一致，但「港版健康碼」應該要配合「安心出行」程式，才能有效追蹤行蹤，認為不可能完全依賴市民自願申報，指市民想享有免檢疫待遇，就有責任提供行蹤。他又相信，內地最重視是外防輸入，香港要在源頭堵截病毒，至於利用「港版健康碼」追蹤傳播鏈只是輔助工具，政府不應該放錯重點。
