有指2020年2月新冠肺炎疫情在港爆發初期，曾發起罷工要求政府封關的醫管局員工陣線，被職工會登記局要求就過去涉及的活動包括醫護罷工、呼籲杯葛政府「安心出行」等提交資料。勞工處指，如職工會違反職工會條例或其會章，不排除會被「釘會」。
報道指，醫管局員工陣線9月收到勞工處轄下的職工會登記局信件，信中要求該會在明日(17日)或之前提交過去涉及的8項活動的資料，包括醫護罷工、呼籲杯葛「安心出行」、「唱衰」由內地研發的科興疫苗、舉辦六四放映會、以及該會前主席余慧明去年參加反對派立法會初選等。
勞工處回覆傳媒查詢時表示，職工會登記局9月3日向一間已登記職工會發出信件，要求就其曾進行的活動提供相關資料，由於跟進工作仍在進行，登記局不適宜評論個別個案。勞工處強調，如職工會違反職工會條例或其會章，登記局定必嚴肅跟進，如違規情況嚴重，不排除取消職工會的登記、即「釘會」。
2019年成立的醫管局員工陣線在社交平台指，該會致力就政治問題、醫院管理局內部問題、醫療系統問題發聲，幫助同業抵抗白色恐怖，爭取應有權益。
