港區國安法列明國安委的決定不受司法覆核，保安局局長李家超強調，執行國安法並非完全不受制衡和監督。他指當事人仍可對國安委以外的執法機關提出司法覆核，或者投訴有關的警員。基本法委員會副主任譚惠珠亦表示，警務處的人員如何執行細則、有無越權、程序是否正確，是可以受司法覆核挑戰。
港區國安法規定，當局辦理國安案件時，部分行動可以在無法庭手令，只是保安局局長或高級警務人員批准下進行，包括搜查地方、凍結財產、要求發布人或服務商移除電子訊息、進行侵擾程度較低的秘密監察等。李家超在一個電視節目上表示，這些行動並非完全不受制約和監察。
他指警務處國安處人員亦受投訴警察課和監警會的制度監管，市民仍然可以作出投訴。對於多個互聯網通訊和社交平台暫停處理港府索取用戶資料要求，李家超強調根據港區國安法，警方可向法庭申請要求服務供應商交出資料；而警務處處長有權懷疑訊息危害國安時，要求供應商移除訊息。李家超又解釋國安法下，截取通訊和秘密監察由特首批准，有別於其他案件由小組法官授權，是因為資料敏感，屬國家級層面。
而基本法委員會副主任譚惠珠在一個研討會上就表示，維護國家安全委員會日前公佈的實施細則本身不受司法覆核，但國安法下有分內地和香港管轄的案件，警務處的人員在執行時有無越權、程序是否正確，是可以受司法覆核挑戰。
她又指若果純粹講法理原則，中央可以要求所有案件都在內地審訊，正如西班牙加泰羅尼亞國會通過獨立，所有政治人物都送到首都馬德里審訊，而不是在巴塞羅那審訊。她說，港區國安法下的安排，是中央尊重「兩制」，讓大部份案件在香港審訊。
