政府提出在路政署下成立「北部都會區鐵路辦事處」〈下稱北部鐵路辦〉，專責統籌未來北部都會區的多個鐵路項目。有議員關注，原先打算增設的鐵路署的項目會否繼續進行。
政府計劃中的「北部鐵路辦」統籌北部都會區多個鐵路項目，將有317個職位，包括52個新職位，其餘由路政署和機電署調派，每年整體薪酬開支預計共超過3億元，如果撇除薪酬開支，每年營運開支就超過1.2億元。
運輸及物流局局長林世雄在立法會特別財委會上表示，政府一直希望成立鐵路署，惟北部都會區發展迅速，跨境鐵路項目進入關鍵規劃階段，加上跨境鐵路問題較複雜，故此提議應先成立「北部鐵路辦」，日後會再審視北部工作及鐵路工程進展，就成立鐵路署聽取意見。林強調，現階段並無放棄成立鐵路署之意，只屬次序問題。
對於新渡輪及港九小輪分別向運輸署申請加價，加幅分別由45%至１倍不等，有議員認為加幅太大，林世雄回應稱，政府會小心把關，審視渡輪公司的營運狀況、載客流量、財政開支，探討碼頭設施增加速遞寄存等非票務收益途徑，以及考慮市民負擔能力等因素。
