日前香港電台節目《鏗鏘集》播出一集關於屯門青山灣入境事務中心的報道，指有入境處人員曾以不人道方式或酷刑對待羈留人士。入境處對有個別媒體作嚴重且失實的指控，表示遺憾及予以譴責，並指該處一直嚴格遵守《待遇令》規定，確保所有被羈留人士均獲得妥善待遇，絕不容許任何暴力或非法行為，呼籲羈留人士若受暴力對待，應要求報警求助。
入境處指， 有個別人士或團體漠視部分被羈留人士，曾濫用免遣返聲請的審核程序，務求繼續非法留港，甚或曾多次在港觸犯嚴重罪行，一旦獲擔保外出可能會對社會構成嚴重治安風險，反而質疑入境處作出羈留決定的合法和必要性，入境處對此深表遺憾並予以嚴厲譴責。
入境處又指，安排被羈留人士在保護室接受醫學觀察，絕不存在懲罰作用，形容部分人士無視中心人員克盡己任，一再作出失實及不公平的指控，強調會繼續團結履行職務。該處又呼籲，若任何人報稱在羈留期間受到暴力對待，應立即向入境處作出投訴或要求報警求助，入境處及相關執法部門一定會依法嚴肅及公平處理。
《鏗鏘集》早前最新一集《囚》指，有被羈留人士獲法庭判決遭到入境處非法羈留，並引述他指曾被入境處人員毆打。報道亦引述律師指，曾聽過羈留人士聲稱被要求裸體在「保護室」獨處24小時，只能以尿片如廁。入境處回應指，「保護室」是用作短暫收容有自殘傾向或情緒不穩人士，承認室內沒有配置獨立廁所，有關人士可通知中心職員安排使用保護室外的洗手間，如情況特殊可提供便盆或其他個人衞生用品。
日前入境處四個員工組織已表示，有關報道立場偏頗及失實，表示極度憤怒及嚴厲譴責。港台日前回覆傳媒查詢時表示：「該集《鏗鏘集》節目曾聯絡入境事務處及相關工會作出回應，節目內已作詳細交代。」
